Los programas y sus líneas de financiamiento responden principalmente a la Política Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico, para asegurar su adecuada y oportuna implementación y cumplir con el propósito de la misma.
La estructura responde a un esquema abierto y a una secuencia que permita la inclusión de nuevos subprogramas, líneas, y categorías o temas, de manera dinámica que respondan a demandas y/o planes nacionales e internacionales que se presenten durante el horizonte temporal de vigencia de la Política.